一、PC抽提法
PC 抽提是去除蛋白質(zhì)有效的手段,但超過(guò)了該飽和度,裂解體系中的蛋白質(zhì)不會(huì)被一次去除,必須靠多次抽提,方可徹底去除。且每次抽提都會(huì)損失部分核酸。另外,體系太粘稠的壞處是,蛋白質(zhì)難以徹底去除,以及基因組DNA 會(huì)斷裂得更厲害,所以要注意裂解液與樣品的比例。
PC 抽提的另外一個(gè)用途是,利用酸性酚可以部分去除DNA 的特點(diǎn),在RNA 抽提時(shí)獲得DNA 殘留極少的RNA。不過(guò)有一點(diǎn)要提醒的是,某些植物樣品,在去除某些雜質(zhì)之前,是不能使用PC 抽提的,否則核酸必定降解。PC抽提最大的優(yōu)勢(shì)是成本低廉,對(duì)實(shí)驗(yàn)條件要求較低,對(duì)于經(jīng)費(fèi)緊張的實(shí)驗(yàn)室較為實(shí)用。
二、高鹽沉淀法
高鹽沉淀蛋白質(zhì)/醇沉淀方法,同樣也是一個(gè)非常不錯(cuò)的方法。與PC 抽提方法相比,除了純度的穩(wěn)定性可能要低一點(diǎn)外,該方法幾乎克服了PC 抽提的所有缺點(diǎn)。更快、更輕松的去除蛋白質(zhì)所可以用于大規(guī)模抽提,但其不足之處是純度(蛋白質(zhì)殘留) 不夠穩(wěn)定,蛋白質(zhì)的沉淀效率在4℃會(huì)更好一些。
三、離心柱法
離心柱純化法,是目前試劑盒提取廣泛應(yīng)用的方法。其最大特點(diǎn)是受人為操作因素影響小,純度的穩(wěn)定性很高(雖然純度不一定比PC 純化方法更高)。加入的液體通過(guò)離心后會(huì)進(jìn)入另外一個(gè)離心管中,與含有核酸的柱子完全是分開(kāi)的,所以洗滌更徹底。其致命弱點(diǎn)是樣品過(guò)量,提取效率較低,且需要反復(fù)離心,操作復(fù)雜,成本也較高。
四、生物磁珠法
生物磁珠法是將純化介質(zhì)包被在納米級(jí)生物磁珠表面,通過(guò)介質(zhì)對(duì)核酸的吸附,在外加磁場(chǎng)下使核酸附著于磁珠定向移動(dòng),從而達(dá)到固液分離純化的作用。